Вносить в книгу учета трудовых книжек сведения о приеме работников, перешедших на ЭКТ, не нужно.
Дело в том, что в книге учета движения трудовых книжек содержится информация только о трудовых книжках в бумажном виде.
Соответственно, если новый сотрудник еще на прошлой работе отказался от бумажной трудовой книжки в пользу электронной, о нем в книге учета трудовых книжек не будет ни слова.